Una sessione di qualifiche a Brno caratterizzata dalle numerose cadute, ne approfitta Pedrosa che non perde l’occasione per superare di millesimi il connazionale Lorenzo (3°), mentre l’americano Ben Spies su Yamaha Monster Tech 3 si piazza al secondo posto.
Buona la prova di Valentino Rossi, che cade nelle battute finali (nessun danno per fortuna) e chiude al quinto posto, affiancandosi in seconda fila con Casey Stoner (4°) ed Andrea Dovizioso (6°).
Nonostante il quarto posto è comunque incolore la prova dei piloti del Team Ducati, con Stoner mai in grado di impensierire costantemente la prima fila (nonostante i suoi tempi in miglioramento) e Hayden addirittura 8°.
Da segnalare la buona prova di De Puniet, rietrato dall’infortunio a tibia e perone, il francese chiude all’11° posto.
Tra gli italiani invece sempre difficoltosa la rincorsa ai primi posti, Capirossi finisce al 10° posto, Simoncelli al 12° e Melandri al 14°.