Dani Pedrosa (Repsol Honda Team) sorprende tutti e va a prendersi la pole position del GP di Sepang con il crono record di 1’59.053. Nulla può nei suoi confronti il team mate Marc Marquez, che, seppur molto performante sul passo gara, accusa oltre quattro decimi di ritardo sul giro secco.
Completa la prima fila Valentino Rossi (Movistar Yamaha MotoGP), che migliora il proprio best lap quando la bandiera a scacchi era stata ormai già esposta. A farne le spese è Jorge Lorenzo (Movistar Yamaha MotoGP), che scatterà dalla quarta casella dello schieramento, affiancando Cal Crutchlow (LCR Honda) ed Andrea Iannone (Ducati Team). Migliora la propria posizione in griglia rispetto alle ultime gare Andrea Dovizioso (Ducati Team), settimo, seguito a sua volta da un sempre più brillante Maverick Viñales (Suzuki Racing Team). Completano la top10 Bradley Smith (Monster Yamaha Tech3), passato prima dalla Q1 (così come il rookie della Suzuki), e Hector Barbera (Avintia Racing), nuovamente primo tra piloti Open.
Con lui ci saranno in quarta fila anche i fratelli Espargaró, con Aleix (Suzuki Racing Team) ad anticipare Pol (Monster Yamaha Tech3). Danilo Petrucci (Octo Pramac Racing) si porta in tredicesima posizione, mettendo così alle proprie spalle Stefan Bradl (Aprilia Racing Team Gresini) e Scott Redding (Estrella Galicia 0,0 Marc VDS).
